Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR1H3Q13133 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NR1H3Q13133 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR1H3Q13133 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR1H3Q13133 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1H3Q13133 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR1H3Q13133 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NR1H3Q13133 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1H3Q13133 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR1H3Q13133 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NR1H3Q13133 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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