Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACACAQ13085 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACACAQ13085 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACACAQ13085 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACACAQ13085 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACACAQ13085 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACACAQ13085 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACACAQ13085 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACACAQ13085 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACACAQ13085 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACACAQ13085 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACACAQ13085 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACACAQ13085 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACACAQ13085 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACACAQ13085 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
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