Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFRD2Q12894 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFRD2Q12894 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFRD2Q12894 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFRD2Q12894 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFRD2Q12894 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFRD2Q12894 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFRD2Q12894 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFRD2Q12894 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFRD2Q12894 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms