Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.81■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC49.79■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC49.78■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
HMGXB3Q12766 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
HMGXB3Q12766 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
HMGXB3Q12766 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
HMGXB3Q12766 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
HMGXB3Q12766 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC49.68■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.65■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
HMGXB3Q12766 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
HMGXB3Q12766 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
HMGXB3Q12766 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC49.55■■■■■ 5.52
HMGXB3Q12766 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
HMGXB3Q12766 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
HMGXB3Q12766 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
HMGXB3Q12766 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC49.5■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC49.46■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.46■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
HMGXB3Q12766 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.5
HMGXB3Q12766 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
HMGXB3Q12766 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
HMGXB3Q12766 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC49.41■■■■■ 5.5
HMGXB3Q12766 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC49.4■■■■■ 5.5
HMGXB3Q12766 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC49.39■■■■■ 5.5
HMGXB3Q12766 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.34■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC49.33■■■■■ 5.49
HMGXB3Q12766 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
HMGXB3Q12766 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC49.25■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC49.22■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC49.22■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC49.2■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
HMGXB3Q12766 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
HMGXB3Q12766 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
HMGXB3Q12766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
HMGXB3Q12766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
HMGXB3Q12766 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC49.1■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
HMGXB3Q12766 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
HMGXB3Q12766 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
HMGXB3Q12766 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
HMGXB3Q12766 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
HMGXB3Q12766 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC49.01■■■■■ 5.44
HMGXB3Q12766 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC48.98■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.96■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC48.96■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC48.96■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
HMGXB3Q12766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC48.93■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.92■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC48.88■■■■■ 5.42
HMGXB3Q12766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
HMGXB3Q12766 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
HMGXB3Q12766 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
HMGXB3Q12766 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
HMGXB3Q12766 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms