Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TEFQ10587 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TEFQ10587 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TEFQ10587 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TEFQ10587 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TEFQ10587 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TEFQ10587 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TEFQ10587 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TEFQ10587 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TEFQ10587 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TEFQ10587 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TEFQ10587 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TEFQ10587 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TEFQ10587 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TEFQ10587 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TEFQ10587 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TEFQ10587 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TEFQ10587 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TEFQ10587 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TEFQ10587 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TEFQ10587 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TEFQ10587 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TEFQ10587 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TEFQ10587 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TEFQ10587 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TEFQ10587 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TEFQ10587 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TEFQ10587 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TEFQ10587 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TEFQ10587 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TEFQ10587 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TEFQ10587 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TEFQ10587 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TEFQ10587 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TEFQ10587 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TEFQ10587 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TEFQ10587 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TEFQ10587 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TEFQ10587 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TEFQ10587 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TEFQ10587 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TEFQ10587 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TEFQ10587 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TEFQ10587 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TEFQ10587 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TEFQ10587 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TEFQ10587 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TEFQ10587 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TEFQ10587 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TEFQ10587 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TEFQ10587 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TEFQ10587 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TEFQ10587 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TEFQ10587 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TEFQ10587 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TEFQ10587 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TEFQ10587 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TEFQ10587 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TEFQ10587 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TEFQ10587 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TEFQ10587 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TEFQ10587 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TEFQ10587 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TEFQ10587 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TEFQ10587 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TEFQ10587 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TEFQ10587 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.22
TEFQ10587 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TEFQ10587 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TEFQ10587 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TEFQ10587 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TEFQ10587 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TEFQ10587 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TEFQ10587 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TEFQ10587 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TEFQ10587 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TEFQ10587 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TEFQ10587 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TEFQ10587 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TEFQ10587 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TEFQ10587 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TEFQ10587 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TEFQ10587 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TEFQ10587 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TEFQ10587 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TEFQ10587 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TEFQ10587 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TEFQ10587 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TEFQ10587 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TEFQ10587 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TEFQ10587 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TEFQ10587 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TEFQ10587 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TEFQ10587 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TEFQ10587 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TEFQ10587 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TEFQ10587 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TEFQ10587 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TEFQ10587 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TEFQ10587 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms