Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DSC1Q08554 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DSC1Q08554 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DSC1Q08554 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DSC1Q08554 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DSC1Q08554 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DSC1Q08554 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSC1Q08554 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSC1Q08554 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms