Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE4DQ08499 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4DQ08499 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDE4DQ08499 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDE4DQ08499 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDE4DQ08499 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDE4DQ08499 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDE4DQ08499 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDE4DQ08499 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms