Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG7P83436 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
COG7P83436 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG7P83436 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG7P83436 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG7P83436 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG7P83436 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG7P83436 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG7P83436 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG7P83436 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG7P83436 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG7P83436 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG7P83436 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG7P83436 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG7P83436 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG7P83436 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
COG7P83436 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG7P83436 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG7P83436 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COG7P83436 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COG7P83436 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG7P83436 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG7P83436 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG7P83436 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG7P83436 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG7P83436 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG7P83436 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG7P83436 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG7P83436 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG7P83436 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG7P83436 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG7P83436 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG7P83436 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG7P83436 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG7P83436 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COG7P83436 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG7P83436 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG7P83436 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COG7P83436 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
COG7P83436 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
COG7P83436 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG7P83436 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COG7P83436 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COG7P83436 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COG7P83436 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG7P83436 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG7P83436 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG7P83436 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG7P83436 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COG7P83436 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG7P83436 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COG7P83436 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COG7P83436 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COG7P83436 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG7P83436 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG7P83436 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG7P83436 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG7P83436 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG7P83436 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG7P83436 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG7P83436 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG7P83436 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG7P83436 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG7P83436 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG7P83436 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG7P83436 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG7P83436 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COG7P83436 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG7P83436 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG7P83436 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG7P83436 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COG7P83436 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG7P83436 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
COG7P83436 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG7P83436 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG7P83436 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG7P83436 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG7P83436 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG7P83436 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG7P83436 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COG7P83436 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG7P83436 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG7P83436 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG7P83436 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG7P83436 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG7P83436 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COG7P83436 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG7P83436 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG7P83436 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG7P83436 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG7P83436 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COG7P83436 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG7P83436 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG7P83436 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG7P83436 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG7P83436 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG7P83436 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG7P83436 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG7P83436 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG7P83436 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms