Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAP1AP78559 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAP1AP78559 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAP1AP78559 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP1AP78559 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAP1AP78559 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MAP1AP78559 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP1AP78559 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAP1AP78559 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms