Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23P62829 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL23P62829 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL23P62829 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL23P62829 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL23P62829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL23P62829 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL23P62829 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL23P62829 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23P62829 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23P62829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23P62829 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23P62829 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23P62829 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23P62829 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL23P62829 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL23P62829 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL23P62829 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23P62829 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23P62829 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23P62829 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23P62829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23P62829 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23P62829 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL23P62829 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL23P62829 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL23P62829 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL23P62829 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23P62829 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23P62829 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23P62829 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23P62829 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23P62829 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23P62829 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23P62829 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23P62829 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23P62829 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL23P62829 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23P62829 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23P62829 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23P62829 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23P62829 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23P62829 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23P62829 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL23P62829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL23P62829 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL23P62829 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RPL23P62829 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPL23P62829 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL23P62829 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL23P62829 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL23P62829 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL23P62829 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL23P62829 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPL23P62829 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL23P62829 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPL23P62829 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPL23P62829 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL23P62829 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL23P62829 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL23P62829 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPL23P62829 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPL23P62829 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPL23P62829 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL23P62829 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL23P62829 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL23P62829 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RPL23P62829 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL23P62829 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL23P62829 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL23P62829 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL23P62829 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL23P62829 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL23P62829 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL23P62829 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL23P62829 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL23P62829 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL23P62829 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL23P62829 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL23P62829 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL23P62829 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL23P62829 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL23P62829 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL23P62829 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL23P62829 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL23P62829 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL23P62829 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL23P62829 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL23P62829 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL23P62829 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL23P62829 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL23P62829 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL23P62829 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL23P62829 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL23P62829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL23P62829 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL23P62829 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL23P62829 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL23P62829 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL23P62829 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms