Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN2P57739 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN2P57739 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN2P57739 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN2P57739 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN2P57739 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN2P57739 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLDN2P57739 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN2P57739 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN2P57739 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN2P57739 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN2P57739 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN2P57739 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN2P57739 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN2P57739 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms