Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB1P54762 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB1P54762 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EPHB1P54762 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB1P54762 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB1P54762 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EPHB1P54762 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EPHB1P54762 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPHB1P54762 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EPHB1P54762 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EPHB1P54762 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
EPHB1P54762 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EPHB1P54762 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EPHB1P54762 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPHB1P54762 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPHB1P54762 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 530.6 ms