Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRAP54198 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HIRAP54198 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRAP54198 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRAP54198 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRAP54198 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRAP54198 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRAP54198 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HIRAP54198 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRAP54198 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
HIRAP54198 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRAP54198 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HIRAP54198 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HIRAP54198 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HIRAP54198 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRAP54198 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
HIRAP54198 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HIRAP54198 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HIRAP54198 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HIRAP54198 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRAP54198 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
HIRAP54198 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
HIRAP54198 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HIRAP54198 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
HIRAP54198 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRAP54198 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HIRAP54198 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
HIRAP54198 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HIRAP54198 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HIRAP54198 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HIRAP54198 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
HIRAP54198 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRAP54198 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HIRAP54198 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRAP54198 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRAP54198 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRAP54198 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HIRAP54198 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
HIRAP54198 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRAP54198 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
HIRAP54198 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
HIRAP54198 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HIRAP54198 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRAP54198 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
HIRAP54198 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HIRAP54198 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIRAP54198 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIRAP54198 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HIRAP54198 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HIRAP54198 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HIRAP54198 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HIRAP54198 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRAP54198 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRAP54198 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HIRAP54198 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRAP54198 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRAP54198 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HIRAP54198 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HIRAP54198 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRAP54198 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRAP54198 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRAP54198 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HIRAP54198 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HIRAP54198 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRAP54198 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRAP54198 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HIRAP54198 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRAP54198 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRAP54198 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRAP54198 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
HIRAP54198 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIRAP54198 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HIRAP54198 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIRAP54198 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HIRAP54198 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HIRAP54198 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HIRAP54198 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HIRAP54198 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRAP54198 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRAP54198 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HIRAP54198 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRAP54198 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HIRAP54198 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HIRAP54198 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRAP54198 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HIRAP54198 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIRAP54198 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
HIRAP54198 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HIRAP54198 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HIRAP54198 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HIRAP54198 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRAP54198 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRAP54198 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIRAP54198 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms