Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUCLG1P53597 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUCLG1P53597 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG1P53597 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG1P53597 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUCLG1P53597 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUCLG1P53597 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SUCLG1P53597 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SUCLG1P53597 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUCLG1P53597 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUCLG1P53597 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLG1P53597 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLG1P53597 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms