Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP2P52943 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP2P52943 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP2P52943 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP2P52943 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRIP2P52943 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRIP2P52943 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP2P52943 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRIP2P52943 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP2P52943 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP2P52943 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP2P52943 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP2P52943 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP2P52943 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP2P52943 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP2P52943 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP2P52943 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP2P52943 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP2P52943 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP2P52943 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP2P52943 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP2P52943 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRIP2P52943 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRIP2P52943 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRIP2P52943 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP2P52943 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRIP2P52943 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms