Protein–RNA interactions for Protein: P52757

CHN2, Beta-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN2P52757 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHN2P52757 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHN2P52757 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHN2P52757 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHN2P52757 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHN2P52757 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHN2P52757 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHN2P52757 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHN2P52757 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHN2P52757 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHN2P52757 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHN2P52757 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHN2P52757 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHN2P52757 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHN2P52757 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHN2P52757 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHN2P52757 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHN2P52757 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHN2P52757 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHN2P52757 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHN2P52757 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHN2P52757 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHN2P52757 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHN2P52757 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHN2P52757 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHN2P52757 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHN2P52757 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHN2P52757 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHN2P52757 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHN2P52757 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHN2P52757 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHN2P52757 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHN2P52757 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHN2P52757 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHN2P52757 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHN2P52757 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHN2P52757 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHN2P52757 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHN2P52757 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHN2P52757 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHN2P52757 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHN2P52757 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHN2P52757 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHN2P52757 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHN2P52757 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHN2P52757 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHN2P52757 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHN2P52757 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHN2P52757 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHN2P52757 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHN2P52757 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHN2P52757 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHN2P52757 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHN2P52757 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN2P52757 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN2P52757 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHN2P52757 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN2P52757 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN2P52757 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN2P52757 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN2P52757 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN2P52757 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHN2P52757 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHN2P52757 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHN2P52757 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN2P52757 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHN2P52757 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN2P52757 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHN2P52757 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHN2P52757 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHN2P52757 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN2P52757 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN2P52757 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHN2P52757 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHN2P52757 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHN2P52757 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHN2P52757 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN2P52757 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHN2P52757 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHN2P52757 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHN2P52757 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHN2P52757 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHN2P52757 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHN2P52757 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHN2P52757 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHN2P52757 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHN2P52757 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN2P52757 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN2P52757 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN2P52757 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHN2P52757 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN2P52757 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHN2P52757 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHN2P52757 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHN2P52757 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHN2P52757 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHN2P52757 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHN2P52757 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHN2P52757 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHN2P52757 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms