Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UBE2D1P51668 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBE2D1P51668 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2D1P51668 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
UBE2D1P51668 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBE2D1P51668 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2D1P51668 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2D1P51668 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms