Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC50.02■■■■■ 5.6
SMARCA2P51531 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC49.99■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
SMARCA2P51531 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
SMARCA2P51531 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
SMARCA2P51531 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
SMARCA2P51531 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC49.92■■■■■ 5.58
SMARCA2P51531 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC49.91■■■■■ 5.58
SMARCA2P51531 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC49.91■■■■■ 5.58
SMARCA2P51531 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
SMARCA2P51531 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC49.73■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC49.7■■■■■ 5.55
SMARCA2P51531 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC49.68■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC49.66■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
SMARCA2P51531 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
SMARCA2P51531 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
SMARCA2P51531 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
SMARCA2P51531 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC49.59■■■■■ 5.53
SMARCA2P51531 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
SMARCA2P51531 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC49.54■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.52■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC49.52■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC49.51■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC49.5■■■■■ 5.52
SMARCA2P51531 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
SMARCA2P51531 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.47■■■■■ 5.51
SMARCA2P51531 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
SMARCA2P51531 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
SMARCA2P51531 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
SMARCA2P51531 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
SMARCA2P51531 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
SMARCA2P51531 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
SMARCA2P51531 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC49.36■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC49.36■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC49.33■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
SMARCA2P51531 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
SMARCA2P51531 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
SMARCA2P51531 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.26■■■■■ 5.48
SMARCA2P51531 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC49.23■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC49.2■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC49.2■■■■■ 5.47
SMARCA2P51531 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC49.17■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.15■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC49.15■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC49.14■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.13■■■■■ 5.46
SMARCA2P51531 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC49.11■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC49.1■■■■■ 5.45
SMARCA2P51531 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC49.09■■■■■ 5.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms