Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSFMP43897 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSFMP43897 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSFMP43897 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSFMP43897 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSFMP43897 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSFMP43897 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSFMP43897 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TSFMP43897 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSFMP43897 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSFMP43897 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSFMP43897 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSFMP43897 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSFMP43897 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSFMP43897 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSFMP43897 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSFMP43897 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSFMP43897 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSFMP43897 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSFMP43897 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSFMP43897 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSFMP43897 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSFMP43897 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSFMP43897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSFMP43897 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSFMP43897 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSFMP43897 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSFMP43897 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSFMP43897 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TSFMP43897 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSFMP43897 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSFMP43897 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSFMP43897 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSFMP43897 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSFMP43897 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSFMP43897 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSFMP43897 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSFMP43897 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSFMP43897 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSFMP43897 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSFMP43897 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSFMP43897 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSFMP43897 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSFMP43897 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSFMP43897 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSFMP43897 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSFMP43897 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSFMP43897 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSFMP43897 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSFMP43897 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSFMP43897 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSFMP43897 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSFMP43897 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSFMP43897 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSFMP43897 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSFMP43897 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSFMP43897 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSFMP43897 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSFMP43897 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSFMP43897 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSFMP43897 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSFMP43897 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSFMP43897 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSFMP43897 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSFMP43897 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TSFMP43897 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSFMP43897 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSFMP43897 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSFMP43897 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSFMP43897 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSFMP43897 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSFMP43897 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSFMP43897 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSFMP43897 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSFMP43897 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSFMP43897 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSFMP43897 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSFMP43897 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSFMP43897 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSFMP43897 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSFMP43897 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSFMP43897 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TSFMP43897 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSFMP43897 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TSFMP43897 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSFMP43897 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSFMP43897 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSFMP43897 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSFMP43897 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSFMP43897 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSFMP43897 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSFMP43897 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSFMP43897 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSFMP43897 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms