Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA4P43694 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA4P43694 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA4P43694 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA4P43694 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA4P43694 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA4P43694 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA4P43694 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA4P43694 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA4P43694 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA4P43694 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA4P43694 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA4P43694 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA4P43694 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA4P43694 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA4P43694 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA4P43694 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA4P43694 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GATA4P43694 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GATA4P43694 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA4P43694 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA4P43694 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GATA4P43694 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA4P43694 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GATA4P43694 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA4P43694 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GATA4P43694 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA4P43694 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA4P43694 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GATA4P43694 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA4P43694 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA4P43694 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GATA4P43694 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GATA4P43694 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GATA4P43694 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA4P43694 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GATA4P43694 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA4P43694 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA4P43694 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GATA4P43694 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA4P43694 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GATA4P43694 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GATA4P43694 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA4P43694 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GATA4P43694 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA4P43694 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GATA4P43694 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA4P43694 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA4P43694 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GATA4P43694 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GATA4P43694 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATA4P43694 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA4P43694 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA4P43694 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA4P43694 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA4P43694 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA4P43694 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA4P43694 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA4P43694 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA4P43694 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA4P43694 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA4P43694 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA4P43694 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA4P43694 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA4P43694 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA4P43694 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA4P43694 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA4P43694 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA4P43694 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATA4P43694 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA4P43694 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA4P43694 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA4P43694 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA4P43694 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA4P43694 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA4P43694 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA4P43694 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA4P43694 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA4P43694 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA4P43694 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA4P43694 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATA4P43694 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA4P43694 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA4P43694 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA4P43694 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA4P43694 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATA4P43694 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA4P43694 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA4P43694 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATA4P43694 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA4P43694 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA4P43694 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA4P43694 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA4P43694 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATA4P43694 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATA4P43694 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GATA4P43694 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA4P43694 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA4P43694 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GATA4P43694 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms