Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ITGAEP38570 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
ITGAEP38570 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ITGAEP38570 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ITGAEP38570 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ITGAEP38570 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ITGAEP38570 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ITGAEP38570 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ITGAEP38570 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ITGAEP38570 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ITGAEP38570 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
ITGAEP38570 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ITGAEP38570 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ITGAEP38570 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ITGAEP38570 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
ITGAEP38570 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
ITGAEP38570 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
ITGAEP38570 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ITGAEP38570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ITGAEP38570 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ITGAEP38570 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ITGAEP38570 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ITGAEP38570 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ITGAEP38570 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
ITGAEP38570 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ITGAEP38570 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ITGAEP38570 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms