Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAL1P37235 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPCAL1P37235 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPCAL1P37235 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPCAL1P37235 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HPCAL1P37235 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPCAL1P37235 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPCAL1P37235 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPCAL1P37235 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HPCAL1P37235 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPCAL1P37235 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPCAL1P37235 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms