Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA5AP35218 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA5AP35218 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CA5AP35218 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CA5AP35218 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CA5AP35218 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CA5AP35218 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CA5AP35218 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CA5AP35218 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CA5AP35218 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CA5AP35218 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CA5AP35218 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CA5AP35218 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CA5AP35218 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CA5AP35218 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CA5AP35218 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CA5AP35218 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA5AP35218 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA5AP35218 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CA5AP35218 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CA5AP35218 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CA5AP35218 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CA5AP35218 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CA5AP35218 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CA5AP35218 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CA5AP35218 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CA5AP35218 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CA5AP35218 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CA5AP35218 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CA5AP35218 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CA5AP35218 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CA5AP35218 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CA5AP35218 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CA5AP35218 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CA5AP35218 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CA5AP35218 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CA5AP35218 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CA5AP35218 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA5AP35218 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA5AP35218 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA5AP35218 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CA5AP35218 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CA5AP35218 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CA5AP35218 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CA5AP35218 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA5AP35218 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA5AP35218 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA5AP35218 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA5AP35218 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA5AP35218 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CA5AP35218 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CA5AP35218 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CA5AP35218 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CA5AP35218 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CA5AP35218 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CA5AP35218 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CA5AP35218 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA5AP35218 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA5AP35218 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA5AP35218 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA5AP35218 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA5AP35218 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CA5AP35218 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CA5AP35218 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA5AP35218 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA5AP35218 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA5AP35218 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CA5AP35218 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CA5AP35218 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CA5AP35218 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CA5AP35218 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CA5AP35218 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA5AP35218 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA5AP35218 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA5AP35218 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CA5AP35218 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CA5AP35218 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA5AP35218 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA5AP35218 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA5AP35218 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CA5AP35218 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CA5AP35218 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CA5AP35218 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CA5AP35218 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA5AP35218 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA5AP35218 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA5AP35218 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CA5AP35218 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CA5AP35218 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CA5AP35218 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA5AP35218 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA5AP35218 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA5AP35218 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA5AP35218 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CA5AP35218 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CA5AP35218 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CA5AP35218 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CA5AP35218 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CA5AP35218 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CA5AP35218 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms