Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCM5P33992 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCM5P33992 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MCM5P33992 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
MCM5P33992 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MCM5P33992 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MCM5P33992 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MCM5P33992 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCM5P33992 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCM5P33992 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCM5P33992 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCM5P33992 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCM5P33992 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
MCM5P33992 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MCM5P33992 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MCM5P33992 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MCM5P33992 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MCM5P33992 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MCM5P33992 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MCM5P33992 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MCM5P33992 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MCM5P33992 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCM5P33992 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCM5P33992 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MCM5P33992 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MCM5P33992 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MCM5P33992 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCM5P33992 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCM5P33992 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCM5P33992 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MCM5P33992 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MCM5P33992 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MCM5P33992 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MCM5P33992 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MCM5P33992 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MCM5P33992 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCM5P33992 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCM5P33992 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
MCM5P33992 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MCM5P33992 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCM5P33992 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MCM5P33992 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MCM5P33992 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
MCM5P33992 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MCM5P33992 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
MCM5P33992 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MCM5P33992 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MCM5P33992 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCM5P33992 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MCM5P33992 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCM5P33992 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MCM5P33992 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
MCM5P33992 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
MCM5P33992 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MCM5P33992 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MCM5P33992 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCM5P33992 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCM5P33992 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCM5P33992 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCM5P33992 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCM5P33992 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCM5P33992 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCM5P33992 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCM5P33992 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCM5P33992 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCM5P33992 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCM5P33992 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCM5P33992 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MCM5P33992 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MCM5P33992 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MCM5P33992 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
MCM5P33992 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
MCM5P33992 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MCM5P33992 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MCM5P33992 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MCM5P33992 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MCM5P33992 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MCM5P33992 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
MCM5P33992 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MCM5P33992 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MCM5P33992 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCM5P33992 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCM5P33992 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCM5P33992 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCM5P33992 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MCM5P33992 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCM5P33992 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCM5P33992 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCM5P33992 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MCM5P33992 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MCM5P33992 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MCM5P33992 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MCM5P33992 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MCM5P33992 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MCM5P33992 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MCM5P33992 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MCM5P33992 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MCM5P33992 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MCM5P33992 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MCM5P33992 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms