Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC1P33527 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ABCC1P33527 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC1P33527 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC1P33527 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC1P33527 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC1P33527 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC1P33527 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC1P33527 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ABCC1P33527 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC1P33527 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
ABCC1P33527 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
ABCC1P33527 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
ABCC1P33527 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC1P33527 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC1P33527 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC1P33527 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC1P33527 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
ABCC1P33527 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC1P33527 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC1P33527 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC1P33527 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC1P33527 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC1P33527 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC1P33527 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC1P33527 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC1P33527 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC1P33527 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
ABCC1P33527 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC1P33527 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC1P33527 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
ABCC1P33527 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC1P33527 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC1P33527 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ABCC1P33527 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ABCC1P33527 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ABCC1P33527 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCC1P33527 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCC1P33527 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCC1P33527 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ABCC1P33527 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms