Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD11P31277 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXD11P31277 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXD11P31277 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HOXD11P31277 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXD11P31277 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD11P31277 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HOXD11P31277 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXD11P31277 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXD11P31277 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXD11P31277 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXD11P31277 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXD11P31277 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms