Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SP100P23497 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SP100P23497 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SP100P23497 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SP100P23497 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SP100P23497 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SP100P23497 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SP100P23497 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SP100P23497 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SP100P23497 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SP100P23497 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SP100P23497 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SP100P23497 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SP100P23497 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SP100P23497 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SP100P23497 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SP100P23497 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SP100P23497 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SP100P23497 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SP100P23497 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SP100P23497 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SP100P23497 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SP100P23497 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SP100P23497 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SP100P23497 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SP100P23497 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SP100P23497 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SP100P23497 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SP100P23497 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP100P23497 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SP100P23497 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SP100P23497 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SP100P23497 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SP100P23497 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SP100P23497 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SP100P23497 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SP100P23497 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SP100P23497 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SP100P23497 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SP100P23497 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP100P23497 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP100P23497 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP100P23497 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP100P23497 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP100P23497 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP100P23497 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP100P23497 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP100P23497 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP100P23497 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP100P23497 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP100P23497 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP100P23497 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP100P23497 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP100P23497 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP100P23497 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SP100P23497 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SP100P23497 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP100P23497 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP100P23497 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SP100P23497 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SP100P23497 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SP100P23497 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP100P23497 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SP100P23497 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP100P23497 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SP100P23497 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SP100P23497 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SP100P23497 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SP100P23497 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP100P23497 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP100P23497 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP100P23497 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SP100P23497 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SP100P23497 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SP100P23497 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SP100P23497 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP100P23497 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP100P23497 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SP100P23497 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP100P23497 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP100P23497 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP100P23497 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP100P23497 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP100P23497 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP100P23497 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP100P23497 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP100P23497 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP100P23497 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SP100P23497 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SP100P23497 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SP100P23497 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SP100P23497 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP100P23497 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP100P23497 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP100P23497 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP100P23497 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP100P23497 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SP100P23497 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SP100P23497 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SP100P23497 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms