Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPREP23469 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTPREP23469 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPREP23469 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPREP23469 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPREP23469 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPREP23469 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPREP23469 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPREP23469 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPREP23469 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
PTPREP23469 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PTPREP23469 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPREP23469 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPREP23469 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPREP23469 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPREP23469 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPREP23469 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPREP23469 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPREP23469 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPREP23469 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPREP23469 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPREP23469 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPREP23469 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPREP23469 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPREP23469 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPREP23469 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPREP23469 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPREP23469 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPREP23469 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPREP23469 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPREP23469 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPREP23469 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPREP23469 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPREP23469 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPREP23469 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPREP23469 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPREP23469 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPREP23469 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPREP23469 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPREP23469 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPREP23469 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPREP23469 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPREP23469 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPREP23469 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPREP23469 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPREP23469 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPREP23469 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPREP23469 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPREP23469 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPREP23469 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPREP23469 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPREP23469 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPREP23469 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPREP23469 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPREP23469 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPREP23469 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPREP23469 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPREP23469 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPREP23469 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPREP23469 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPREP23469 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPREP23469 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPREP23469 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPREP23469 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPREP23469 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPREP23469 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPREP23469 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPREP23469 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPREP23469 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPREP23469 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPREP23469 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPREP23469 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPREP23469 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPREP23469 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPREP23469 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPREP23469 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPREP23469 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPREP23469 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPREP23469 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPREP23469 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPREP23469 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPREP23469 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPREP23469 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPREP23469 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPREP23469 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPREP23469 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPREP23469 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPREP23469 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPREP23469 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPREP23469 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPREP23469 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPREP23469 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPREP23469 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPREP23469 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPREP23469 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPREP23469 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPREP23469 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPREP23469 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPREP23469 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPREP23469 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
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