Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRBP23467 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRBP23467 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRBP23467 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRBP23467 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRBP23467 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRBP23467 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRBP23467 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRBP23467 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRBP23467 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
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