Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALB2P22676 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALB2P22676 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALB2P22676 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALB2P22676 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALB2P22676 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALB2P22676 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALB2P22676 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALB2P22676 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALB2P22676 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALB2P22676 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALB2P22676 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALB2P22676 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALB2P22676 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALB2P22676 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALB2P22676 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALB2P22676 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALB2P22676 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CALB2P22676 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALB2P22676 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CALB2P22676 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALB2P22676 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALB2P22676 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALB2P22676 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALB2P22676 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALB2P22676 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALB2P22676 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALB2P22676 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALB2P22676 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALB2P22676 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALB2P22676 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALB2P22676 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALB2P22676 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALB2P22676 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CALB2P22676 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALB2P22676 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALB2P22676 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALB2P22676 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALB2P22676 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALB2P22676 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALB2P22676 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALB2P22676 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALB2P22676 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALB2P22676 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALB2P22676 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALB2P22676 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALB2P22676 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALB2P22676 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CALB2P22676 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CALB2P22676 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALB2P22676 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALB2P22676 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALB2P22676 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALB2P22676 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALB2P22676 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALB2P22676 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALB2P22676 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALB2P22676 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALB2P22676 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALB2P22676 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALB2P22676 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALB2P22676 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALB2P22676 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALB2P22676 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALB2P22676 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CALB2P22676 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALB2P22676 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALB2P22676 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALB2P22676 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALB2P22676 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALB2P22676 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALB2P22676 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB2P22676 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB2P22676 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB2P22676 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CALB2P22676 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB2P22676 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CALB2P22676 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB2P22676 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB2P22676 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALB2P22676 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB2P22676 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB2P22676 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALB2P22676 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALB2P22676 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALB2P22676 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALB2P22676 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALB2P22676 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CALB2P22676 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALB2P22676 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB2P22676 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB2P22676 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALB2P22676 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB2P22676 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB2P22676 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB2P22676 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALB2P22676 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB2P22676 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB2P22676 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALB2P22676 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms