Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NF1P21359 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NF1P21359 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NF1P21359 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NF1P21359 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NF1P21359 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NF1P21359 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NF1P21359 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NF1P21359 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NF1P21359 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NF1P21359 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NF1P21359 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NF1P21359 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NF1P21359 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NF1P21359 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NF1P21359 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF1P21359 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF1P21359 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NF1P21359 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NF1P21359 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF1P21359 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NF1P21359 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NF1P21359 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF1P21359 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF1P21359 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF1P21359 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NF1P21359 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF1P21359 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF1P21359 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF1P21359 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF1P21359 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF1P21359 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF1P21359 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF1P21359 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF1P21359 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF1P21359 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF1P21359 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NF1P21359 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NF1P21359 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NF1P21359 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NF1P21359 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NF1P21359 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NF1P21359 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NF1P21359 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NF1P21359 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NF1P21359 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NF1P21359 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NF1P21359 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NF1P21359 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF1P21359 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF1P21359 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF1P21359 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF1P21359 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NF1P21359 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF1P21359 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NF1P21359 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF1P21359 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NF1P21359 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF1P21359 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF1P21359 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NF1P21359 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NF1P21359 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NF1P21359 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NF1P21359 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NF1P21359 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NF1P21359 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NF1P21359 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NF1P21359 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NF1P21359 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NF1P21359 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NF1P21359 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NF1P21359 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NF1P21359 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NF1P21359 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NF1P21359 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NF1P21359 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NF1P21359 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NF1P21359 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NF1P21359 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NF1P21359 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF1P21359 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NF1P21359 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF1P21359 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF1P21359 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NF1P21359 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NF1P21359 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NF1P21359 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NF1P21359 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF1P21359 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF1P21359 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF1P21359 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NF1P21359 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NF1P21359 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NF1P21359 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms