Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF3P15923 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF3P15923 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF3P15923 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCF3P15923 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCF3P15923 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF3P15923 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF3P15923 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF3P15923 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF3P15923 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF3P15923 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCF3P15923 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TCF3P15923 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF3P15923 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF3P15923 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF3P15923 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF3P15923 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCF3P15923 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCF3P15923 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCF3P15923 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCF3P15923 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCF3P15923 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCF3P15923 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCF3P15923 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF3P15923 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF3P15923 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF3P15923 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCF3P15923 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF3P15923 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCF3P15923 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF3P15923 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCF3P15923 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF3P15923 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCF3P15923 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF3P15923 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCF3P15923 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF3P15923 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF3P15923 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF3P15923 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF3P15923 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF3P15923 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCF3P15923 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCF3P15923 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCF3P15923 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF3P15923 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF3P15923 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF3P15923 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF3P15923 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF3P15923 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCF3P15923 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCF3P15923 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TCF3P15923 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TCF3P15923 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF3P15923 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF3P15923 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TCF3P15923 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF3P15923 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCF3P15923 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCF3P15923 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCF3P15923 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF3P15923 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF3P15923 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCF3P15923 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF3P15923 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCF3P15923 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF3P15923 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF3P15923 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCF3P15923 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCF3P15923 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCF3P15923 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCF3P15923 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCF3P15923 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCF3P15923 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCF3P15923 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCF3P15923 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCF3P15923 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCF3P15923 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCF3P15923 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCF3P15923 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCF3P15923 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCF3P15923 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TCF3P15923 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCF3P15923 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCF3P15923 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF3P15923 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF3P15923 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF3P15923 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF3P15923 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCF3P15923 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCF3P15923 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCF3P15923 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCF3P15923 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCF3P15923 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCF3P15923 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCF3P15923 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF3P15923 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF3P15923 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF3P15923 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF3P15923 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCF3P15923 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms