Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR89BP0CG08 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPR89BP0CG08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPR89BP0CG08 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPR89BP0CG08 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPR89BP0CG08 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR89BP0CG08 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPR89BP0CG08 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPR89BP0CG08 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPR89BP0CG08 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPR89BP0CG08 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPR89BP0CG08 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPR89BP0CG08 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPR89BP0CG08 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPR89BP0CG08 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPR89BP0CG08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPR89BP0CG08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms