Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO3P0C6S8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO3P0C6S8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINGO3P0C6S8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO3P0C6S8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINGO3P0C6S8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINGO3P0C6S8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINGO3P0C6S8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms