Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRTAP1-4P0C5Y4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-4P0C5Y4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-4P0C5Y4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-4P0C5Y4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1232.7 ms