Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
C4AP0C0L4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
C4AP0C0L4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
C4AP0C0L4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
C4AP0C0L4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
C4AP0C0L4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
C4AP0C0L4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
C4AP0C0L4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
C4AP0C0L4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
C4AP0C0L4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
C4AP0C0L4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C4AP0C0L4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
C4AP0C0L4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
C4AP0C0L4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
C4AP0C0L4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
C4AP0C0L4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C4AP0C0L4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
C4AP0C0L4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
C4AP0C0L4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C4AP0C0L4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
C4AP0C0L4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms