Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB40ALP0C0E4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB40ALP0C0E4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB40ALP0C0E4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB40ALP0C0E4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB40ALP0C0E4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB40ALP0C0E4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB40ALP0C0E4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB40ALP0C0E4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms