Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD63P08962 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD63P08962 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD63P08962 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD63P08962 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD63P08962 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD63P08962 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD63P08962 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD63P08962 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD63P08962 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD63P08962 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD63P08962 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD63P08962 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD63P08962 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD63P08962 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD63P08962 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD63P08962 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD63P08962 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD63P08962 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD63P08962 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD63P08962 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD63P08962 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD63P08962 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD63P08962 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD63P08962 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD63P08962 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD63P08962 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD63P08962 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD63P08962 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD63P08962 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD63P08962 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD63P08962 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD63P08962 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD63P08962 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD63P08962 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD63P08962 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD63P08962 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD63P08962 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD63P08962 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD63P08962 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD63P08962 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD63P08962 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD63P08962 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD63P08962 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD63P08962 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD63P08962 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD63P08962 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD63P08962 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD63P08962 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD63P08962 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD63P08962 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD63P08962 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CD63P08962 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD63P08962 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD63P08962 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD63P08962 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD63P08962 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD63P08962 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD63P08962 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD63P08962 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD63P08962 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD63P08962 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD63P08962 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD63P08962 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD63P08962 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD63P08962 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD63P08962 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD63P08962 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD63P08962 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD63P08962 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD63P08962 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD63P08962 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD63P08962 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD63P08962 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD63P08962 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD63P08962 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD63P08962 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD63P08962 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD63P08962 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD63P08962 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD63P08962 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CD63P08962 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD63P08962 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD63P08962 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD63P08962 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD63P08962 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD63P08962 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms