Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAP2AP05549 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAP2AP05549 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFAP2AP05549 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAP2AP05549 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAP2AP05549 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAP2AP05549 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAP2AP05549 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAP2AP05549 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2AP05549 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFAP2AP05549 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAP2AP05549 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAP2AP05549 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAP2AP05549 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms