Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCBP05166 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCBP05166 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCBP05166 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCBP05166 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCBP05166 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCBP05166 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCBP05166 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCCBP05166 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCCBP05166 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCCBP05166 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCBP05166 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCCBP05166 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCCBP05166 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCBP05166 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCCBP05166 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCBP05166 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCBP05166 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCCBP05166 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCBP05166 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCBP05166 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCCBP05166 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCBP05166 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCBP05166 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCBP05166 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCCBP05166 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCCBP05166 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCCBP05166 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCCBP05166 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCCBP05166 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCCBP05166 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCCBP05166 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCCBP05166 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCCBP05166 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCCBP05166 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCCBP05166 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCCBP05166 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCCBP05166 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCCBP05166 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCCBP05166 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCCBP05166 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCCBP05166 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCCBP05166 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCBP05166 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCCBP05166 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCBP05166 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCCBP05166 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCBP05166 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCCBP05166 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCBP05166 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCCBP05166 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCBP05166 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCCBP05166 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCBP05166 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCCBP05166 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCBP05166 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCCBP05166 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCCBP05166 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCBP05166 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCBP05166 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCBP05166 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCBP05166 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCCBP05166 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCCBP05166 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCBP05166 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCCBP05166 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCBP05166 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCCBP05166 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCCBP05166 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCCBP05166 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCCBP05166 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCBP05166 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCBP05166 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCCBP05166 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCCBP05166 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCCBP05166 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCCBP05166 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCCBP05166 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCCBP05166 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCCBP05166 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCCBP05166 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCCBP05166 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCCBP05166 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCCBP05166 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCCBP05166 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCCBP05166 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCCBP05166 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCCBP05166 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCCBP05166 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCCBP05166 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCCBP05166 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCCBP05166 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCCBP05166 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCCBP05166 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCCBP05166 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCCBP05166 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCCBP05166 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCCBP05166 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCCBP05166 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCCBP05166 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms