Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYBBP04839 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CYBBP04839 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYBBP04839 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYBBP04839 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYBBP04839 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYBBP04839 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYBBP04839 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CYBBP04839 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CYBBP04839 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYBBP04839 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYBBP04839 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CYBBP04839 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYBBP04839 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYBBP04839 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYBBP04839 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYBBP04839 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYBBP04839 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYBBP04839 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYBBP04839 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYBBP04839 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYBBP04839 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYBBP04839 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYBBP04839 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYBBP04839 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYBBP04839 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYBBP04839 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYBBP04839 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYBBP04839 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYBBP04839 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYBBP04839 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYBBP04839 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYBBP04839 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYBBP04839 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYBBP04839 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYBBP04839 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CYBBP04839 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYBBP04839 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYBBP04839 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYBBP04839 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYBBP04839 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYBBP04839 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYBBP04839 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYBBP04839 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYBBP04839 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYBBP04839 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYBBP04839 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYBBP04839 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYBBP04839 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYBBP04839 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYBBP04839 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYBBP04839 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYBBP04839 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYBBP04839 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYBBP04839 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYBBP04839 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYBBP04839 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYBBP04839 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYBBP04839 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYBBP04839 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CYBBP04839 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYBBP04839 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYBBP04839 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYBBP04839 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYBBP04839 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYBBP04839 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYBBP04839 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYBBP04839 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYBBP04839 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYBBP04839 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYBBP04839 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYBBP04839 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYBBP04839 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYBBP04839 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYBBP04839 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYBBP04839 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYBBP04839 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYBBP04839 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYBBP04839 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYBBP04839 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYBBP04839 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYBBP04839 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYBBP04839 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYBBP04839 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYBBP04839 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYBBP04839 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYBBP04839 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYBBP04839 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYBBP04839 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYBBP04839 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYBBP04839 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYBBP04839 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYBBP04839 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYBBP04839 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYBBP04839 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYBBP04839 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYBBP04839 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYBBP04839 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYBBP04839 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CYBBP04839 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1100.1 ms