Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NSD2O96028 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NSD2O96028 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NSD2O96028 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NSD2O96028 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NSD2O96028 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NSD2O96028 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
NSD2O96028 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NSD2O96028 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NSD2O96028 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
NSD2O96028 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NSD2O96028 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NSD2O96028 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NSD2O96028 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NSD2O96028 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NSD2O96028 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NSD2O96028 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NSD2O96028 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NSD2O96028 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NSD2O96028 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NSD2O96028 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NSD2O96028 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NSD2O96028 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NSD2O96028 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NSD2O96028 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NSD2O96028 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NSD2O96028 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NSD2O96028 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NSD2O96028 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NSD2O96028 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NSD2O96028 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NSD2O96028 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NSD2O96028 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NSD2O96028 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NSD2O96028 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NSD2O96028 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NSD2O96028 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NSD2O96028 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NSD2O96028 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NSD2O96028 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NSD2O96028 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NSD2O96028 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NSD2O96028 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NSD2O96028 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NSD2O96028 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NSD2O96028 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NSD2O96028 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NSD2O96028 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
NSD2O96028 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NSD2O96028 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NSD2O96028 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NSD2O96028 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NSD2O96028 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NSD2O96028 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NSD2O96028 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NSD2O96028 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NSD2O96028 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NSD2O96028 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NSD2O96028 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NSD2O96028 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NSD2O96028 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NSD2O96028 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NSD2O96028 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NSD2O96028 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NSD2O96028 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD2O96028 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD2O96028 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD2O96028 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NSD2O96028 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NSD2O96028 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NSD2O96028 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NSD2O96028 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NSD2O96028 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NSD2O96028 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NSD2O96028 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NSD2O96028 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NSD2O96028 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NSD2O96028 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
NSD2O96028 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NSD2O96028 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD2O96028 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD2O96028 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NSD2O96028 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NSD2O96028 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NSD2O96028 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NSD2O96028 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NSD2O96028 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NSD2O96028 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NSD2O96028 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NSD2O96028 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NSD2O96028 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NSD2O96028 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NSD2O96028 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NSD2O96028 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
NSD2O96028 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NSD2O96028 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NSD2O96028 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD2O96028 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD2O96028 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NSD2O96028 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms