Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TBX18O95935 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TBX18O95935 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TBX18O95935 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX18O95935 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX18O95935 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBX18O95935 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBX18O95935 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX18O95935 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX18O95935 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBX18O95935 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX18O95935 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TBX18O95935 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBX18O95935 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX18O95935 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX18O95935 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX18O95935 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBX18O95935 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TBX18O95935 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX18O95935 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBX18O95935 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX18O95935 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX18O95935 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBX18O95935 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX18O95935 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX18O95935 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX18O95935 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX18O95935 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX18O95935 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBX18O95935 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBX18O95935 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX18O95935 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TBX18O95935 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBX18O95935 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TBX18O95935 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBX18O95935 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TBX18O95935 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TBX18O95935 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBX18O95935 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TBX18O95935 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TBX18O95935 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TBX18O95935 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBX18O95935 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBX18O95935 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBX18O95935 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX18O95935 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX18O95935 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TBX18O95935 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBX18O95935 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBX18O95935 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBX18O95935 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TBX18O95935 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBX18O95935 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TBX18O95935 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TBX18O95935 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBX18O95935 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBX18O95935 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBX18O95935 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBX18O95935 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TBX18O95935 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TBX18O95935 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX18O95935 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX18O95935 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX18O95935 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX18O95935 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TBX18O95935 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TBX18O95935 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBX18O95935 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBX18O95935 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TBX18O95935 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TBX18O95935 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TBX18O95935 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TBX18O95935 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TBX18O95935 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TBX18O95935 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TBX18O95935 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX18O95935 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TBX18O95935 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBX18O95935 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBX18O95935 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBX18O95935 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBX18O95935 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBX18O95935 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBX18O95935 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBX18O95935 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBX18O95935 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBX18O95935 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBX18O95935 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBX18O95935 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBX18O95935 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBX18O95935 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBX18O95935 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TBX18O95935 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBX18O95935 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBX18O95935 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBX18O95935 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TBX18O95935 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TBX18O95935 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TBX18O95935 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TBX18O95935 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms