Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
DDX58O95786 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DDX58O95786 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
DDX58O95786 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDX58O95786 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
DDX58O95786 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
DDX58O95786 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DDX58O95786 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DDX58O95786 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
DDX58O95786 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDX58O95786 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DDX58O95786 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DDX58O95786 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DDX58O95786 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
DDX58O95786 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDX58O95786 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDX58O95786 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DDX58O95786 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DDX58O95786 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DDX58O95786 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DDX58O95786 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DDX58O95786 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
DDX58O95786 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DDX58O95786 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DDX58O95786 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX58O95786 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX58O95786 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DDX58O95786 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
DDX58O95786 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DDX58O95786 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DDX58O95786 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DDX58O95786 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
DDX58O95786 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
DDX58O95786 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DDX58O95786 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
DDX58O95786 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDX58O95786 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDX58O95786 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDX58O95786 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
DDX58O95786 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
DDX58O95786 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX58O95786 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
DDX58O95786 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
DDX58O95786 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
DDX58O95786 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
DDX58O95786 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
DDX58O95786 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX58O95786 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX58O95786 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX58O95786 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
DDX58O95786 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DDX58O95786 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
DDX58O95786 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
DDX58O95786 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
DDX58O95786 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
DDX58O95786 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
DDX58O95786 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DDX58O95786 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DDX58O95786 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DDX58O95786 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DDX58O95786 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDX58O95786 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DDX58O95786 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DDX58O95786 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DDX58O95786 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DDX58O95786 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DDX58O95786 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DDX58O95786 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDX58O95786 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDX58O95786 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DDX58O95786 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
DDX58O95786 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DDX58O95786 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX58O95786 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DDX58O95786 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DDX58O95786 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDX58O95786 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DDX58O95786 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DDX58O95786 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DDX58O95786 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDX58O95786 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDX58O95786 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDX58O95786 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDX58O95786 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DDX58O95786 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX58O95786 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
DDX58O95786 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
DDX58O95786 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DDX58O95786 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
DDX58O95786 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX58O95786 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX58O95786 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
DDX58O95786 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX58O95786 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX58O95786 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX58O95786 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
DDX58O95786 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX58O95786 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
DDX58O95786 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
DDX58O95786 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms