Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD4O95243 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MBD4O95243 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MBD4O95243 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MBD4O95243 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MBD4O95243 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD4O95243 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MBD4O95243 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MBD4O95243 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MBD4O95243 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MBD4O95243 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD4O95243 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD4O95243 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MBD4O95243 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MBD4O95243 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD4O95243 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD4O95243 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MBD4O95243 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD4O95243 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MBD4O95243 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD4O95243 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MBD4O95243 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MBD4O95243 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MBD4O95243 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MBD4O95243 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MBD4O95243 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
MBD4O95243 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MBD4O95243 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MBD4O95243 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MBD4O95243 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
MBD4O95243 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MBD4O95243 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MBD4O95243 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MBD4O95243 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
MBD4O95243 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MBD4O95243 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MBD4O95243 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MBD4O95243 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
MBD4O95243 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MBD4O95243 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MBD4O95243 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MBD4O95243 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
MBD4O95243 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MBD4O95243 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MBD4O95243 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MBD4O95243 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MBD4O95243 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MBD4O95243 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MBD4O95243 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MBD4O95243 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MBD4O95243 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MBD4O95243 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MBD4O95243 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MBD4O95243 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MBD4O95243 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MBD4O95243 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
MBD4O95243 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MBD4O95243 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MBD4O95243 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MBD4O95243 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MBD4O95243 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
MBD4O95243 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MBD4O95243 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MBD4O95243 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MBD4O95243 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MBD4O95243 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MBD4O95243 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
MBD4O95243 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MBD4O95243 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MBD4O95243 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MBD4O95243 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MBD4O95243 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MBD4O95243 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MBD4O95243 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MBD4O95243 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MBD4O95243 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MBD4O95243 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MBD4O95243 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD4O95243 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD4O95243 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD4O95243 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD4O95243 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD4O95243 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD4O95243 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD4O95243 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD4O95243 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD4O95243 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD4O95243 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD4O95243 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD4O95243 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD4O95243 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
MBD4O95243 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD4O95243 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD4O95243 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD4O95243 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD4O95243 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD4O95243 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD4O95243 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD4O95243 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MBD4O95243 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms