Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCC1O94876 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCC1O94876 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCC1O94876 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMCC1O94876 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCC1O94876 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMCC1O94876 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMCC1O94876 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMCC1O94876 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCC1O94876 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCC1O94876 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCC1O94876 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMCC1O94876 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCC1O94876 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCC1O94876 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCC1O94876 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMCC1O94876 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMCC1O94876 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMCC1O94876 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMCC1O94876 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCC1O94876 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCC1O94876 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCC1O94876 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMCC1O94876 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMCC1O94876 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCC1O94876 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms