Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEC24DO94855 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24DO94855 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC24DO94855 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC24DO94855 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC24DO94855 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24DO94855 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC24DO94855 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24DO94855 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC24DO94855 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24DO94855 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24DO94855 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24DO94855 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms