Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUBNO60494 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUBNO60494 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUBNO60494 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUBNO60494 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUBNO60494 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUBNO60494 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUBNO60494 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUBNO60494 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUBNO60494 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUBNO60494 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUBNO60494 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUBNO60494 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUBNO60494 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUBNO60494 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUBNO60494 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUBNO60494 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CUBNO60494 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CUBNO60494 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUBNO60494 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CUBNO60494 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CUBNO60494 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUBNO60494 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CUBNO60494 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CUBNO60494 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CUBNO60494 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CUBNO60494 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CUBNO60494 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CUBNO60494 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUBNO60494 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUBNO60494 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUBNO60494 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUBNO60494 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUBNO60494 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUBNO60494 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUBNO60494 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUBNO60494 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUBNO60494 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUBNO60494 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUBNO60494 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUBNO60494 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUBNO60494 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUBNO60494 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUBNO60494 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUBNO60494 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUBNO60494 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUBNO60494 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUBNO60494 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUBNO60494 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUBNO60494 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUBNO60494 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUBNO60494 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUBNO60494 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUBNO60494 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUBNO60494 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUBNO60494 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUBNO60494 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUBNO60494 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUBNO60494 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUBNO60494 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUBNO60494 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUBNO60494 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUBNO60494 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUBNO60494 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUBNO60494 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUBNO60494 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUBNO60494 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUBNO60494 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUBNO60494 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUBNO60494 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CUBNO60494 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUBNO60494 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUBNO60494 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUBNO60494 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUBNO60494 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CUBNO60494 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUBNO60494 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUBNO60494 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUBNO60494 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUBNO60494 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUBNO60494 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUBNO60494 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUBNO60494 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUBNO60494 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CUBNO60494 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CUBNO60494 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUBNO60494 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUBNO60494 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUBNO60494 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUBNO60494 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CUBNO60494 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUBNO60494 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CUBNO60494 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUBNO60494 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CUBNO60494 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CUBNO60494 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUBNO60494 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUBNO60494 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUBNO60494 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUBNO60494 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms