Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3O43889 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREB3O43889 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3O43889 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3O43889 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3O43889 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3O43889 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3O43889 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3O43889 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3O43889 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3O43889 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3O43889 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3O43889 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3O43889 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3O43889 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3O43889 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3O43889 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3O43889 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3O43889 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3O43889 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3O43889 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3O43889 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3O43889 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3O43889 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3O43889 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3O43889 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3O43889 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3O43889 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CREB3O43889 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CREB3O43889 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB3O43889 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB3O43889 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB3O43889 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3O43889 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3O43889 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3O43889 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3O43889 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3O43889 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3O43889 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3O43889 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREB3O43889 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3O43889 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREB3O43889 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3O43889 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3O43889 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3O43889 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3O43889 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3O43889 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CREB3O43889 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CREB3O43889 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3O43889 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3O43889 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3O43889 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3O43889 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3O43889 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3O43889 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3O43889 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CREB3O43889 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3O43889 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3O43889 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3O43889 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3O43889 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3O43889 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB3O43889 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB3O43889 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3O43889 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3O43889 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB3O43889 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3O43889 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB3O43889 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB3O43889 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3O43889 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3O43889 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3O43889 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB3O43889 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3O43889 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CREB3O43889 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3O43889 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB3O43889 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3O43889 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3O43889 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB3O43889 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3O43889 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CREB3O43889 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB3O43889 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3O43889 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB3O43889 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3O43889 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB3O43889 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3O43889 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3O43889 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB3O43889 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3O43889 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3O43889 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB3O43889 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3O43889 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB3O43889 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CREB3O43889 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3O43889 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CREB3O43889 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms