Protein–RNA interactions for Protein: O43379

WDR62, WD repeat-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 1,518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR62O43379 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
WDR62O43379 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
WDR62O43379 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
WDR62O43379 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
WDR62O43379 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
WDR62O43379 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
WDR62O43379 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
WDR62O43379 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
WDR62O43379 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC47.72■■■■■ 5.23
WDR62O43379 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
WDR62O43379 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
WDR62O43379 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
WDR62O43379 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
WDR62O43379 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
WDR62O43379 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
WDR62O43379 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC47.63■■■■■ 5.22
WDR62O43379 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
WDR62O43379 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC47.62■■■■■ 5.21
WDR62O43379 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
WDR62O43379 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC47.57■■■■■ 5.21
WDR62O43379 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
WDR62O43379 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
WDR62O43379 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
WDR62O43379 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
WDR62O43379 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
WDR62O43379 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
WDR62O43379 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
WDR62O43379 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
WDR62O43379 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
WDR62O43379 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC47.5■■■■■ 5.19
WDR62O43379 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
WDR62O43379 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
WDR62O43379 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
WDR62O43379 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
WDR62O43379 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
WDR62O43379 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
WDR62O43379 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
WDR62O43379 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
WDR62O43379 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
WDR62O43379 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
WDR62O43379 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
WDR62O43379 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
WDR62O43379 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
WDR62O43379 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC47.35■■■■■ 5.17
WDR62O43379 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
WDR62O43379 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
WDR62O43379 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
WDR62O43379 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
WDR62O43379 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
WDR62O43379 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
WDR62O43379 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
WDR62O43379 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
WDR62O43379 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
WDR62O43379 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
WDR62O43379 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
WDR62O43379 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
WDR62O43379 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
WDR62O43379 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
WDR62O43379 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
WDR62O43379 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC47.18■■■■■ 5.14
WDR62O43379 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
WDR62O43379 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
WDR62O43379 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
WDR62O43379 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
WDR62O43379 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
WDR62O43379 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
WDR62O43379 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
WDR62O43379 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
WDR62O43379 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
WDR62O43379 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
WDR62O43379 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
WDR62O43379 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
WDR62O43379 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
WDR62O43379 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
WDR62O43379 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
WDR62O43379 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
WDR62O43379 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
WDR62O43379 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
WDR62O43379 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
WDR62O43379 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
WDR62O43379 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
WDR62O43379 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
WDR62O43379 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
WDR62O43379 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
WDR62O43379 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
WDR62O43379 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
WDR62O43379 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
WDR62O43379 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
WDR62O43379 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
WDR62O43379 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
WDR62O43379 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
WDR62O43379 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
WDR62O43379 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
WDR62O43379 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
WDR62O43379 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
WDR62O43379 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.93■■■■■ 5.1
WDR62O43379 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
WDR62O43379 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
WDR62O43379 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
WDR62O43379 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms